Der Gemeinderat ist unter Vorbehalt der Rechte der Stimmberechtigten das zentrale Führungsorgan und trägt in diesem Rahmen die Gesamtverantwortung für die Gemeinde (Exekutive). Er vertritt die Gemeinde und bereitet die Geschäfte vor, die den Stimmberechtigten zur Abstimmung unterbreitet werden. Weiter sorgt er insbesondere für die demokratische Führung der Gemeinde sowie für eine nachhaltige Finanzierung der Aufgaben.

Der Gemeinderat Knutwil besteht aus fünf Mitgliedern, dem Präsidium und vier weiteren Ressortverantwortlichen. Die Wahl des Rates erfolgt auf eine Amtsdauer von vier Jahren, welche jeweils am 1. September nach den kantonal angesetzten Gesamterneuerungswahlen startet.

Der Gemeinderat Knutwil versammelt sich in der Regel alle drei Wochen zu einer halbtägigen Sitzung.